targetを考慮しないで全て新しいタブ開くっていう設定が見あたらない。
わかりやすく言うと、googleで別ウインドウで開く設定にしてても複数のページを開くと全部同じタブで開こうとする。なんでgoogleは_blank指定じゃないんだというツッコミはともかくこれは不便。別ウインドウで開く設定をやめてCtrl+クリックを使うべきでしょうか。
あと、他のアプリからURLを開くときはアクティブになってほしいけど、最初から_blankなリンクを開くときはアクティブになってほしくない。これはTab Mix Plusでは両方「新しいウインドウに開くはずだったタブ」としてまとめられているのです。